* Клан Абурамэ (яп. 油女一族 Абурамэ Итидзоку, досл. «Семья Абурамэ») специализируется на использовании насекомых в качестве оружия и в то же время защиты. Создаётся т. н. симбиоз — ниндзя, впуская насекомых в собственное тело, позволяет им питаться своей чакрой, а те взамен выполняют его приказы.
     Известные представители: Сино Абурамэ
   
    * Клан Акимити (яп. 秋道一族 Акимити Итидзоку, досл. «Семья Акимити») основывает свои атаки на мгновенном увеличении размеров тела за счёт перерабатываемых в чакру потребляемых калорий (из-за чего все представители клана много едят и поэтому страдают излишним весом).
    Известные представители: Тёдзи Акимити
   
    * Клан Ёцуки (яп. 夜月一族 Ёцуки Итидзоку, досл. «Семья Ёцуки») — видный клан Деревни, Скрытой в Облаках.
    Известные представители: Четвёртый Райкагэ, Киллер Би

    * Клан Инудзука (яп. 犬塚一族 Инудзука Итидзоку, досл. «Семья Инудзука») основывает свои атаки на взаимодействии с псами-ниндзя (яп. 忍犬 Нинкэн).
    Известные представители: Киба Инудзука, Хана Инудзука

    * Клан Кагуя (яп. かぐや一族 Кагуя Итидзоку, досл. «Семья Кагуя») — вымерший к началу второй части манги род, прославившийся благодаря своей жестокости.
    Известные представители: Кимимаро Кагуя

    * Клан Нара (яп. 奈良一族 Нара Итидзоку, досл. «Семья Нара») известен благодаря способности манипуляции тенями, а также выращиванию оленей на принадлежащей им территории. Также обладает многими накопленными знаниями в области медицины.
    Известные представители: Сикамару Нара

    * Клан Сарутоби (яп. 猿飛一族 Сарутоби Итидзоку, досл. «Семья Сарутоби») — один из самых влиятельных кланов.
    Известные представители: Третий Хокагэ, Асума Сарутоби, Конохамару

    * Клан Сэндзю (яп. 千手一族 Сэндзю Итидзоку, досл. «Семья Сэндзю») рассматривался как один из сильнейших кланов мира в эпоху до создания скрытых деревень. Вместе с Утихами основал Коноху.
    Известные представители: Первый Хокагэ, Второй Хокагэ, Пятая Хокагэ

    * Клан Удзумаки (яп. うずまき一族 Удзумаки Итидзоку, досл. «Семья Удзумаки») — видный клан Страны Водоворотов, члены которого были мастерами запечатывающих техник и обладали большим запасом чакры. В знак их дружбы с Конохой в форме синоби последних используется символ Удзумаки.
    Известные представители: Наруто Удзумаки, Кусина Удзумаки, Мито Удзумаки, Нагато

    * Клан Утиха (яп. うちは一族 Утиха Итидзоку, досл. «Семья Утиха») некогда был одним из сильнейших кланов, члены которого обладали наследственным додзюцу, сяринганом. Наряду с Сэндзю стоял у истоков основания Деревни, Скрытой в Листве. Большинство членов клана погибло в кровавой резне, устроенной Итати Утихой по приказу руководства Конохи.
    Известные представители: Мадара Утиха, Итати Утиха, Саскэ Утиха, Сисуй Утиха, Обито Утиха

    * Клан Хюга (яп. 日向一族 Хюга Итидзоку, досл. «Семья Хюга») — один из наиболее старых и уважаемых в Конохе, члены которой обладают наследственным кэккэй гэнкай, бякуганом, что даёт им расширенное поле зрения и способность видеть систему циркуляции чакры.
    Известные представители: Нэдзи Хюга, Хината Хюга, Ханаби Хюга, Хиаси Хюга, Хидзаси Хюга

    * Клан Яманака (яп. 山中一族 Яманака Итидзоку, досл. «Семья Яманака») специализируется на сенсорных и телепатических способностях, позволяющих, к примеру, манипулировать сознанием оппонента. Также имеет собственный магазин цветов.
    Известные представители: Ино Яманака, Иноити Яманака